Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA1P25391 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA1P25391 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms