Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKCHP24723 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
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