Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PTPREP23469 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPREP23469 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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