Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD53P19397 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms