Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XBP1P17861 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms