Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRAP16234 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms