Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms