Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms