Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI3P10071 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI3P10071 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI3P10071 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI3P10071 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI3P10071 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLI3P10071 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms