Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACAA1P09110 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms