Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms