Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMDSO60547 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms