Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNC1O60486 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms