Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPLO60437 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPLO60437 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPLO60437 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms