Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms