Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASKO14936 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms