Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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