Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KPZ7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KPZ7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KPZ7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KPZ7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KPZ7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KPZ7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KPZ7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KPZ7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KPZ7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KPZ7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms