Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms