Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms