Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms