Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms