Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms