Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms