Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms