Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP36Q9P275 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms