Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms