Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms