Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms