Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms