Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX1Q9NSU2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX1Q9NSU2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX1Q9NSU2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms