Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms