Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSPNQ9HAW4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms