Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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