Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL11BQ9C0K0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms