Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP4Q9C0A0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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