Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000962.2-201ENST00000624971 1101 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01965-201ENST00000412112 1378 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003991.1-203ENST00000591739 719 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms