Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2Q9BX26 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms