Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1orf50Q9BV19 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms