Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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