Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM29Q9BSF4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms