Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms