Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYD88Q99836 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms