Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms