Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD4LQ96PU5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms