Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDC1Q96MU7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
YTHDC1Q96MU7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
YTHDC1Q96MU7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
YTHDC1Q96MU7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms