Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms