Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM5Q96HS1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms