Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms