Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM54Q969K7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms